长茎葡萄蕨藻含有重要活性物质，如蕨藻倍半萜（caulerpenyne, CYN），其主要功效在于，当藻体受到机械损伤后，CYN可转化成Oxytoxin-2,封住细胞损伤部位（Adolphetal.,2005）。另外，CYN也可用于治疗痛风，CYN对XOD（黄嘌呤氧化酶）活性有抑制效应。XOD的酶活测定用黄嘌呤作为底物在磷酸缓冲液中检测292nm吸收值的增值（Cengizetal.,2011）。由于Caulerpa racemosa被认为是地中海的入侵种，因此，CYN的含量多少与其入侵密切相关。Cava et al.(2012)发现C.racemosa 和 C.prolifera 中的CYN的变化与Rubisco酶活性密切关联，采用2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4-磷酸（MEP）方法，对Rubisco酶活性进行测定，以深入开展CYN代谢有关的甲羟戊酸途径研究。C.taxifolia 中有2种倍半萜Caulerpal A 和 Caulerpal B，均为脂肪酶的抑制剂，能够治疗肥胖症；也可抑制蛋白酪氨酸激酶活性，用于治疗二型糖尿病（Mao et al.,2006）。

长茎葡萄蕨藻的提取物有抗病毒，抗肿瘤活性。从中分离的多糖对巨噬细胞有免疫刺激活性，其中的木聚糖水解成平均5个单糖分子的寡糖，可诱导人体乳腺癌细胞MCF-7核染色质凝聚，以及polyADPribose polymerase(二磷酸腺苷核糖多聚酶)的沉降，均有诱导癌细胞凋亡的作用（Maeda et al.,2011b）。